A Fundação Educacional Sorocabana é administrada por um Conselho Superior e dirigida por uma diretoria composta de Presidente, Vice-Presidente, Diretor Secretário e um Diretor Financeiro.
O Conselho Superior, segundo seu estatuto, é composto de 22 (vinte e dois) membros titulares, sendo 11 (onze) escolhidos dentre os professores efetivos das Instituições mantidas e 11 (onze) dentre as pessoas integrantes da comunidade Sorocabana, todos com o direito a voto. O Prefeito Municipal e o Presidente da Câmara Municipal são nomeados Conselheiros Honorários.
Trata-se de uma composição equilibrada, que mescla as duas mais altas autoridades municipais, representantes da comunidade sorocabana e representantes dos docentes. Ao longo de sua história a Fundação, tem fornecido bolsas de estudos à alunos carentes, colaborando, assim, para a inclusão social das camadas menos favorecidas de Sorocaba e região.